一、磷酸是一种独立存在的物质；二、磷酸基团是通过化学键连接在其他物质上时的磷酸，磷酸基团是不能独立存在的；三、dna与atp中叫法不同是因为：dna稳定，磷酸一直存在于dna上，只有一种形态，称之为磷酸即可（磷酸基团）；四、atp不稳定，磷酸易水解，这时磷酸基团就会变成磷酸。
磷酸是一种独立存在的物质，可以和金属反应，一般用于制备其它酸；而磷酸基团是通过化学键连接在其他物质上时的磷酸，是不能独立存在的，但其具有很强的配合能力，能与许多金属离子生成可溶性的配合物。
正磷酸是由一个单一的磷氧四面体构成的磷酸。在磷酸分子中P原子是sp3杂化的，3个杂化轨道与氧原子间形成3个σ键，另一个P—O键是由一个从磷到氧的σ配键和两个由氧到磷的d-pπ键组成的。σ配键是磷原子上的一对孤对电子向氧原子的空轨道配位而形成。
d←p配键是氧原子的py、pz轨道上的两对孤对电子和磷原子的dxz、dyz空轨道重叠而成。由于磷原子3d能级比氧原子的2p能级能量高很多，组成的分子轨道不是很有效的，所以P—O键从数目上来看是三重键，但从键能和键长来看是介于单键和双键之间。
