蛋白质中与DNA结合的motif有哪些?各有何特点?
锌指结构
一种常出现在DNA结合蛋白中的一种结构基元。是由一个含有大约30个氨基酸的环和一个与环上的4个Cys或2个Cys和2个His配位的Zn2+构成,形成的结构像手指状。锌指结构指的是在很多蛋白中存在的一类具有指状结构的结构域,这些具有锌指结构的蛋白大多都是与基因表达的调控有关的功能蛋白。锌指结构的共同特征是通过肽链中氨基酸残基的特征集团与Zn2+的结合来稳定一种很短的,可自我折叠成“手指”形状的的多肽空间构型。
亮氨酸拉链
出现地DNA结合蛋白质和其它蛋白质中的一种结构基元。当来自同一个或不同多肽链的两个两用性的α-螺旋的疏水面(常常含有亮氨酸残基)相互作用形成一个圈对圈的二聚体结构时就形成了亮氨酸拉链。
motif 在分子生物学中是什么意思 ?怎么翻译???
motif是在许多蛋白质分子中,由几个具有二级结构的肽段在空间上相互接近、相互作用,所形成的折叠模样称为超二级结构,又称为模体。锌指结构是一种常见的模体。motif在生物学中是一个基于数据的数学统计模型,典型的是一段sequence也可以是一个结构,是特定的group的序列预测,例如一个DNA sequence可以定义为转录因子结合位点,也就是序列倾向于被这种factor结合。对蛋白质来说,sequence motifs可以被定义为蛋白质(蛋白质序列)属于一个给定的蛋白质家族。一个简单的motif可以是,例如,一个模式pattern,而这个模式被这个group中的所有成员共享。例如WTRXEKXXY(这里,X代表任何氨基酸)。当然也有更复杂的motif模型。Motif有时和特定的功能联系一起。motif在生物学上翻译成,模体,模序,基序等。扩展资料常见模体:1、左手超螺旋——3根右手α-螺旋拧到一起形成一个左手超螺旋;2、右手超螺旋——3根左手螺旋拧到一起形成一个右手超螺旋,如胶原蛋白;3、卷曲螺旋——相邻的2根右手α-螺旋拧到一起形成一个左手超螺旋;4、螺旋束——多个α-螺旋的聚合体;5、β-折叠-α-螺旋β-折叠,即βαβ;6、β-发夹环——两个反平行β-股由一个环相连;7、α-螺旋-β-转角-α-螺旋,即αβα;8、α-螺旋-环-α-螺旋(EF手相);9、Rossmann卷曲——也称Rossmann折叠,它由两个βαβ连在一起,形成βαβαβ结构,通常能结合辅酶I;10、希腊钥匙模体——是一种全β折叠聚合体,存在于许多不同类型的蛋白质中,因在拓扑学上像古代花瓶上的希腊钥匙而得名,清蛋白原就含有这种模体。参考资料:百度百科-模体