商州城，狭义是指隋唐在丹水流域上游所建的一座城池。
清《商州赋》载：“其城，则左龙右凤，台峙丹流，二丈七尺之高。俨临翠甸，五里三分之大”。是说商州城在该地东龙山和金凤山之间，丹水绕城作为护城河；城墙高约9米；从高处望去，南门对岸三台叠翠与城里的房脊相互映衬，城廓周长约2650米的范围大小。今仍有一段保留在该地莲湖公园中。
广义是指今商州和商洛市的中心位置。
商州区地处丹江源头，因城区坐落于丹江之北，北靠金凤山，南面龟山，形如鹤翔，故有“鹤城”之称。商州历史悠久，古有商鞅封邑、四皓隐居、闯王屯兵，是革命战争年代鄂豫陕根据地的中心区域；商州生态环境优美，生物资源丰实，森林覆盖率58.7%，是一片山绿水清的土地；商州文化底蕴深厚，既有北方之粗犷，又兼南国之灵秀，商於古道自古到今曾留下了无数文人墨客的不朽诗篇。商州交通便捷，是西北与东南的交通要道，沪陕高速、福银高速公路、洛商高速公路、商柞高速公路（规划）、宁西铁路、312国道、宁西铁路二线（在建）、西武高铁（规划）、西商城际高铁（规划）穿境而过，西安商洛机场也正在建设之中，交通十分便利。首届中国秦岭生态旅游节在秦岭山中魅力城市商洛举办。
2015年2月，经陕西省人民政府批准：撤销麻池河镇、砚池河镇，并入杨斜镇，撤销上官坊镇，并入闫村镇，撤销西荆镇，并入大荆镇，撤销黑龙口镇并入牧护关镇、在原麻池河镇、砚池河镇、牧护关镇、上官坊镇、西荆镇所在地分别设立便民服务中心。商州区并镇后辖14个镇、4个街道办事处。撤并130个村，保留255个村。保留31个社区居委会不变。
商州辖：城关街道、大赵峪街道、陈塬街道、刘湾街道、夜村镇、沙河子镇、杨峪河镇、金陵寺镇、黑山镇、杨斜镇、麻街镇、牧护关镇、大荆镇、腰市镇、板桥镇、北宽坪镇、阎村镇、三岔河镇。商州行政区划
开发区：商丹循环工业经济园区、商洛市丹南新区、南秦城市新区、商州区荆河生态工业园
1路 东龙驾校-商洛职院（西校区）（25站）
2路 中心广场-比亚迪厂（18站）
3路 金凤路站-铁沟口站(7站）
5路 金凤路站-夜村镇站（9站）
6路 车管所-收费站（13站）
8路 商洛学院站-杨峪河镇站(18站)
9路 杨台站-刘湾站（14站）
10 路 水库站 -静泉山(16站)
11路 比亚迪厂-仙娥湖(22站)
12路 商洛国际会议中心- -商洛职业技术学院(17站)
15路商洛汽车站- -商洛职业技术学院
旅游线路 仙娥湖站-静泉山（9站）
城关街道办事处城关街道办事处位于北新街香菊路1号，是商洛市和商州区所在地，是商州区的政治、经济、文化及商贸活动中心，总面积22平方公里，下辖13个居民委员会和10个村民委员会（61个村民小组）， 26378 户，其中农业户3433户，总人口83989。耕地面积3640亩。
大赵峪街道大赵峪街道办事处地处商州城东，丹江北岸，北邻龙王庙，东至沙河子镇大面河桥，西邻城关街道办事处东店子村，312国道、西合铁路穿境而过。全办总面积53平方公里，呈北高南低地形，辖 11个行政村，1个社区，93个村民小组，19554人。辖区内有中、省、市、区企业26家。
陈塬街道陕西省商洛市商州区陈塬街道办事处地处312国道沿线，有川道，有山区，辖区面积30.18平方公里。2007年全办共有11个村，91个村民小组，共有3635户，其中农业户3604户，共有总人口14346人，其中农业人口14036人，共有耕地面积8572亩。
刘湾街道刘湾街道办事处地处商州城区南郊，丹江南岸，312国道及蓝商高速公路穿境而过，市污水处理厂、江南住宅小区、威尼斯水城、陕西商丹循环经济园区等在此驻足，辖区内有静泉山、龟山风景旅游区，交通较为便利，是一片正在开发的热土。全办共辖24个行政村，1个社区，141个村民小组，6087户，24359人（其中农业人口22414人），总面积106.7平方公里，耕地面积14603亩，劳动力10754个。
金陵寺镇陕西省商州市商州区金陵寺镇位于商州城区西部。面积88平方千米，共5578户20485人（2010年），其中农业人口5565户19083人。辖杨口村、房店子村、上竹园村、石灰窑、卢扒、东窑、西窑、铁沟、刘村、任村、孙塬、边山、鸡山、天山、管坪、赫庄、樵塬、崔巷18个行政村，109个村民小组。金陵寺镇面积112.3平方千米，总户数5782，其中农户5731，总人口20126，农业人口18641，总劳力共9483。镇政府驻杨口村，距市区18千米。辖区东西宽，南北狭窄，属中温二类地区。全镇耕地17584亩，零星植树77000株，畜牧业生产势头良好。耕地以山坡地和坡塬地居多，平地较少，因而农业生产机械化较低。2013年全年粮食产量5065吨，农村经济总收入18142万元，农民人均纯收入5905元。金陵寺集市农历双日逢集，远近闻名，是全区规模较大的集市之一。有金陵寺中学（含高中）及管坪中学等学校。这里，自然资源十分丰富，有煤、石灰石、大理石等。金陵寺镇新农村：2012年年底已建成上竹园村一组移民搬迁住房，共44户，位于芋园洼口。
金陵寺镇交通便利，商熊公路穿境而过，公路距离203省道10km、蓝商高速13km，2004年已全面修通柏油路，有通村公交线路（3路）贯通全镇，每天有两班去往省城西安的长途车经过，交通便捷；有完全中学（含高中部、职教部、初中部）一所，师生1900余人；文化芬围浓厚，有区级重点文物保护单位1个，熊耳山稳居于中，还有商州“八景十观”之一的“熊耳晚霞”；有中心卫生院一所；有35KV变电站一座；能满足全镇人民的物质文化精神文明需要，也能满足外来客商投资兴业的需求。
传说金陵寺名称源于明朝，明太祖朱元璋的叔父在该镇建立寺庙，朱元璋做了皇帝之后，找到了叔父所在的寺庙，便御赐寺庙名称为金陵寺，自此之后，该镇便叫金陵寺镇，该镇母亲河也命名为金陵寺河。
杨峪河镇杨峪河镇位于商州城区中部。属半山半川镇。面积138平方千米，共8827户32656人（2007年）。杨峪河镇地理位置辖26个行政村，248个村民小组，8827 户，32656 人，拥有劳动力13073个，耕地面积17553亩。全镇 138 平方公里，占土地总面积的20.6%。福银高速公路、商（州）柞（水）公路穿境而过，交通便利。商洛市区第二大水源地南秦水库建在该镇。
黑山镇黑山镇位于商州城区西南部，共3391户13483人（2010年）。辖13个行政村，111个村名小组。镇政府驻张坪村。黑山镇地处流岭南麓，商州城区正南方。距市区35公里。东邻山阳县元子街镇，西邻砚池河乡，南邻山阳县二峪河乡，北邻闫村乡，商砚公路穿镇而过。下辖13个行政村，111个村民小组，3658户，14544 人。全镇土地面积90 平方公里，耕地 8273 亩。福银高速公路、商（州）山（阳）公路穿境而过，交通便利。
杨斜镇商州区杨斜镇位于秦王山下，地处商州城区西南方30公里，与蓝田县和柞水县接壤，商柞公路及在修的蓝商高速公路穿境而过。全镇总面积145.3平公里，耕地资源19093亩，辖18个行政村，161个村民小组、4369户、16912人，交通较为便利，是一个农业为主，多种经营并举的山区乡镇。福银高速公路、商（州）柞（水）公路穿境而过，交通便利。2015年2月砚池河镇、麻池河镇并入杨斜镇。
原砚池河镇
砚池河镇位于商州城区西南部，东、北与杨斜、麻池河、黑山三乡镇毗邻，西、南同山阳、柞水两县接壤。共2506户（2010年）。辖8个行政村，54个村民小组。镇政府驻砚池河村，距市区60余千米。景点有秦王山森林公园、观音洞，三官古洞。辖区内有闻名的砚池河溶洞群。2011年7月撤乡设镇。
原麻池河镇
麻池河镇位于商州城区西部秦王山下。面积86平方千米，共2876户12138人（2007年）。辖11个行政村，57个村民小组。镇政府驻金联村，距市区30千米。福银高速公路、商（州）柞（水）公路穿境而过，交通便利。2011年7月撤乡设镇。
夜村镇夜村镇为于陕西省商洛市商州城区城东22公里处，镇所辖15个村，110个村民小组，4242户，16548人，312国道、西合铁路和商界高速公路穿境而过，地理交通位置较为发达，夜村镇域面积114平方公里，耕地面积13761亩，人均纯收入1752元，是商州东部较大的建制镇。沪陕高速、宁西铁路、宁西铁路二线（在建）穿境而过，交通便利。
沙河子镇沙河子镇地处商州城东10公里处，312国道和西合铁路穿境而过。全镇辖24个村委会，213个村民小组，7295户。全镇总面积110平方公里，其中耕地面积19832亩。为陕西商丹循环经济园区主要区域，比亚迪等一系列大厂纷纷落户该镇，目前正在设成为商洛的副中心城市。沪陕高速、宁西铁路、宁西铁路二线（在建）穿境而过，交通便利。商洛火车站位于该镇。
麻街镇麻街镇位于商州城区中北部。面积118.3平方千米，共4210户17649人（2007年）。辖10个行政村，68个村民小组。镇政府驻自愿村。312国道过境，丹江河流经境内。麻街镇位于商州城西二十余里处，“312”国道横穿腹地，交通便捷，全镇土地面积1183公顷，下辖10个行政村，68个村民小组，4210户，17649人。
牧护关镇牧护关镇位于陕西省商洛市商州城区西部，下辖8个行政村，40个村民小组，2471户，9849人，农村实有劳力4385人。全镇总面积80.4平方公里，其中耕地面积4901亩，人均耕地0.47亩；山林总面积96724亩，人均9.24亩；森林覆盖率95%以上，属九山半水半分田的高寒边远山区。辖区内有闻名西北的滑雪场，牧户关滑雪场，312国道穿境而过，交通便利。2015年2月黑龙口镇并入牧户关镇。
原黑龙口镇
陕西省商洛市商州区黑龙口镇地处秦岭山脚，丹江源头，商州城区西北边陲，距州城 50公里，自古便是商洛出深山进平原的关口要道，亦是商贾游客必经的驿站。现在的黑龙口312国道、101省道穿境而过，交通更为便利。全镇总面积96平方公里，境内群山环绕，沟岔纵横，山川兼具，七盘河、韩峪川、闵家河三大流域分布其中。总人口20713人。312国道穿境而过，交通便利。2015年2月黑龙口镇并入牧户关镇。
大荆镇大荆镇位于秦岭南麓，丹江上游，距商州城区38公里。全镇共辖34个村行政村、194个村民小组。2001年撤市设区更名为商洛市商州区大荆镇人民政府。2002年10月实行村级合并，行政村由原34个合并为27个。2003年11月村民小组由原194个合并为143个。全镇辖27个村、143个村民小组、7174户、28321人，其中农业户数7149户，农业人口26966人，劳动力10622个，耕地面积20183亩，总面积121平方公里。是一个“八山一水一分田”乡镇。大荆镇东临李庙、腰市，南接板桥、麻街，西与西荆乡相连，北接蓝田、洛南两县，大荆河贯穿全境，洛洪公路从中部横穿而过，西南铁路纵贯东南，大板路和荆灞路贯通全镇南北，商州区荆河生态工业园便位于该镇，西商二线高速公路已经建成通车，宁西铁路二线正在建设中。地理位置优越，交通便利，生态环境优美，山清水秀，人杰地灵，文化底蕴深厚。2015年2月西荆镇并入大荆镇。
原西荆镇
西荆镇位于商州城区西北部，面积60平方千米，共3139户12031人（约2007年），其中农业人口11799人。辖11个行政村，78个村民小组。镇政府驻西荆村，距商州城区40千米。2011年7月撤乡设镇。2015年2月西荆镇并入大荆镇。
腰市镇腰市镇位于商洛市商州城区北部，距市区中心45公里，东与洛南县，商州区蒲峪乡和板桥镇接壤，西与商州区李庙乡、大荆镇相连，毗邻312国道，洛洪二级公路穿腹而过，是一个交通便利，人口集中，经济、政治、文化都比较发达的乡镇，素有文化之乡的美誉。现在的腰市镇是由原来的腰市乡、郭村乡、马角乡三个乡合并而成的建制镇（2011年原李庙乡并入腰市镇）。全镇总面积150平方公里，现辖20个行政村，114个村民小组，5263户，总人口21431人，其中农业人口20992人，耕地面积17172亩，人均耕地0.81亩。西商二线高速公路、洛商高速公路已经建成通车，宁西铁路二线正在建设中，交通便利。
板桥镇板桥镇位于商州城区北部，西商二线高速公路、洛商高速公路已经建成通车，宁西铁路二线正在建设中，交通便利。
北宽坪镇北宽坪镇位于商州城区东北部，东邻丹凤县，北接洛南县。面积154平方千米，人口15016人（2007年或2010年）。辖17个行政村，74个村民小组。镇政府驻宽坪村，距城区约45千米。是商州区最大的林区与重点森林资源保护乡镇之一。
三岔河镇三岔河镇地处商州城区西南之三十公里处，秦岭腹地，自然面积约23万亩，其中山林面积21万亩，耕地11853亩。全镇辖七星村、灯塔村、黄鱼沟村、阎坪村、秦龙村、秦庙村、杨峪沟村、三星村、三岔河村、康河村10个村委会，58个小组，3465户，13240人，劳动力5231人。2011年7月撤乡设镇。
阎村镇阎村镇位于商州城区南部，面积73平方千米。共1733户，6622人（2007年）。辖8个行政村，59个村民小组。镇政府驻阎村村，距市区31千米。203省道、G70福银高速公路过境。1996年，面积60平方千米，人口0.7万人，辖阎家村、沙河湾、双垭、花园村、安沟村、磨沟、磨沟口、安武、华良沟、姚举沟、大西沟11个行政村。2011年，撤销阎村乡设立阎村镇，福银高速公路、商（州）山（阳）公路穿境而过，交通便利。2011年7月撤乡设镇。
原上官坊镇
上官坊镇位于商州城区南部，北邻沙河子镇、刘湾街道，西接阎村乡，南连山阳县。面积72平方千米，人口7108人（2007年或2010年）。辖7个行政村，78个村民小组。镇政府驻街道村，距市中心54千米。山高沟深，南部庐山主峰高2300米。318省道过境。2011年7月撤乡设镇。2015年2月上官坊镇并入阎村镇。
