在小说中的定位
在《哈利·波特》系列小说中，神秘事务司是隶属于（虚构的）英国魔法界最高领导机关“魔法部”，主要负责各种重大的、秘密的魔法事项，职责高度保密。
在小说中出现的情况
在《哈利·波特》系列小说中曾多次提到过这个地方，特别是在该小说的第5部《哈利。波特与凤凰社》（中文繁体版翻译为《哈利波特与凤凰密令》）中，哈利。波特在此与伏地魔手下的食死徒们展开了殊死决战，小天狼星布莱克也在此战死。
在小说的第4部《哈利。波特与火焰杯》中，韦斯莱先生为哈利·波特介绍来宾时，也曾提到过神秘事务司，并有如下的对话：
“……博德和古洛克……他们的工作无可奉告。”
“他们是做什么的？”
“是
神秘事务司
的，绝密，不知道他们在做什么……”圆形房间Circular Room
由于神秘事务司工作的秘密属性，产生了那里正在发生什么的流言。卢娜·洛夫古德，认为像《唱唱反调》里所说的，康奈利·福吉“用神秘事务司研制可怕的毒药，偷偷对跟他有分歧的人下药”很明显，没有显著的证据足以证明这是真的。
到神秘事务司必须通过升降梯，出升降梯的栅栏后，一个简陋的走廊通向朴素的黑门。打开这扇纯黑色门后，进入圆形黑色房间。
他们正站在一间巨大的圆形屋子里。这里所有的东西，包括天花板和地板全部都是黑色的；十二扇一模一样、没有标记、也没有把手的黑色房门彼此隔开一些距离嵌在四周黑色的墙壁上，一些冒着蓝色火苗的蜡烛点缀在墙上，冷冷的，闪烁着的微弱烛光倒映在光亮的大理石的地板上，使地板上看上去像是有一汪黑水似的。
当通往圆形房间的门关上，圆形的墙壁就会快速的旋转，让人搞不清是从哪个门进来的。
大脑厅Brain Room
这间方形的屋子显得非常明亮。屋子里几乎是空荡荡的，只有一张桌子，另外在屋子里的正中央有一个巨大的盛着墨绿色液体的玻璃水箱，大的足够让他们在里面游泳；许多白色的东西正慢慢悠悠地在里面飘来飘去。当大脑从水箱里的液体出来时，它后面的思想触角会立刻缠绕到那个人身上。这个房间里也有通往其它房间的门。
死亡厅Death Chamber
神秘事务司的帷幔
推断这件屋子的名字是根据邓布利多的那句话：“你会看到死刑室里有几个逃跑的食死徒，被反幻影移形咒绑着，等待着你去处置他们。”但有很多地方被译成“死亡之室”，这是不符合原文的，请注意。这一间比刚才那一间大一些，光线昏暗，呈方形，中心凹陷，形成一个巨大的石坑，大约有二十英尺深。石头台阶环绕着整个屋子，如同石凳，一级一级逐渐下降，每一级都很陡峭，就像是阶梯教室，或是哈利曾被威森加摩审问过的审判室。
石坑的中心没有放着带铁链的椅子，取而代之的是一个凸起的石台，它的上面立着一个拱门，看上去很古老，破烂不堪，在《哈利·波特与凤凰社》中哈利奇怪它居然还能立在那里不倒下来。拱门四周没有墙壁支撑，一幅破破烂烂的黑色窗帘抑或者是帷幔挂在上面，尽管这里空气冷冷的，没有一丝风，可它却在轻轻地摆动，仿佛是刚刚被人摸过。
如果每个台阶是4英尺宽，这个石坑是12英尺，并且在到达最底下的台阶之前，在这个石台周围有20英尺半径，房间是至少132英尺 ——几乎半个足球场。
在《哈利·波特与凤凰社》中小天狼星倒在帷幔后面。现在只有两个人还在激战，很明显，他们谁也没有注意到邓布利多的到来。哈利看到小天狼星矮身闪过了贝拉特里克斯的一道红光：他正在嘲笑她。“得了，你可以做得更好！”他高声喊着，声音在整个巨穴般的屋子里回荡。第二道光束正好击中了他的前胸。
卢娜和哈利能听到帷幔后面有人说话。“我也听得到，”卢娜小声说着也来到拱门这一边和他们站在一起，她注视着拂动的帷幔，“那里面有人！”
没有人知道帷幔彼岸究竟有什么，为什么哈利和卢娜能听到说话声。当然我们可以猜测，就象能见到夜骐那样，能听见帷幔彼岸声音的人也许也是见证过死亡的人才行的。
锁住的屋子Locked Room
这个房间的门被锁住了，没有任何能够破解的咒语或魔法事物可以打开它。在《哈利·波特与凤凰社》中哈利用了（小天狼星送他的）可以打开任何锁的魔法小刀，但是刀刃被熔化了，门依旧是那样关得死死的。
“神秘事务司里有一间屋子，”邓布利多打断了他的话，“始终锁着。那里面有一种力量，比死亡，比人类的智慧，比自然的力量更神奇，更可怕。他或许也是神秘事务司里许多需要研究的课题中最神秘莫测的一个，你拥有那间屋子里的全部能量，而伏地魔却一点也没有。”这个能量就是“爱”。
时间厅Time Room
这个房间充满了美丽的，钻石般闪烁的跳跃光芒。每个表面都可以找到钟表，“它们大小不一，有落地大座钟也有旅行钟，或悬挂在书架之间，或是立在有整个屋子那么长的桌子上。正因为如此，一种急促的永无休止的滴答声充满了整个屋子，像是成千上万细微的列队行进的整齐的脚步声。那道钻石般明亮的跳跃光芒来自房间尽头一个高高耸立着的钟形水晶玻璃罩。这个钟形水晶玻璃罩有哈利那么高，立在一张桌子上，看上去里面充满了一股翻腾的、闪闪发光的气流。在罩子里面，一个小小的、像宝石一般明亮的物体（蛋）上下漂浮着。这个物体是一只小蜂鸟，但它并不总是一只鸟。在它循环轨迹的底端，这只鸟是带着它的蛋的。当它在玻璃玻璃罩里升起来的时候，啪的一下裂开了，一只蜂鸟冒出来，径直升到玻璃罩的最顶部。但随着气流的下落，小鸟的羽毛被再次弄脏，淋湿，直至降落到玻璃罩的最底部，被再次关进蛋里。这个时间的过程在罩里面无休止的重复。一个带着有玻璃前面的壁橱，壁橱所在的那面墙上挂满了各式各样的沙漏。
"He led the way forward down the narrow space between lines of desks," 我并没有找到能确切说明办公室在时间厅中的原文段落，不过纵观打斗那部分可以推断，办公室在时间厅中。
在钟形玻璃罩后有通向预言厅的唯一一扇门。
预言大厅Prophecy
预言大厅
预言大厅是一个巨大的冷冰冰的房间，和教堂一样高，里面排满了高耸的架子。上面摆满灰扑扑的小玻璃球。每个玻璃球下面的架子上都贴着泛黄的小标签。一些小球发出神秘的流动的光，另外一些模糊而黑暗，就像熄灭了的灯泡。更多的烛台隔着间隔嵌在架子上，火苗和黑色大厅一样是蓝色的。离时间之屋的门最近的这组架子是第53排。右面的是第54排，紧接着是第55排，以次类推。大厅里的光线非常暗淡模糊。蜡烛位于每排架子的尽头两端，意思是说，从这一端看过去，远处的另一端是一片漆黑。有些小玻璃球从内部隐隐发出光晕而其它的却是冷冷的、暗淡无光。牵涉哈利的那则预言被放在第97排的尽头靠向里一点的地方。办公室The Office
一间黑乎乎、乱糟糟的小办公室。我们知道那间办公室是很小的。它由一张桌子，一个书架，和四周的石墙，那一次只能容纳五个人。它不像是一个老板的办公室，因此我猜测它是一个无法形容的，可怕的，无可言喻的办公室。
行星室Planet Room
一间满是行星的黑屋子，那真是个怪地方，有时候我们就漂浮在黑暗中……冥王星在眼前爆炸了。
在《哈利·波特与凤凰社》中当哈利在时间厅里时：“有来自附近一个房间的一阵呼喊声，然后一阵碰撞声和尖叫声。”这或许是来自行星厅，但却没有说过其他听到不同声音来自不同房间，这或许是个伏笔也说不定。但它能说明卢娜从“右边出来”实际上是从哈利后面出来，第二，它还说明，行星厅和大脑厅挨在一起。
