其论“国策”卷文，因陈言时弊中肯，深受嘉庆帝器重，特恩赐状元，委任翰林院编撰。不久，在朝廷群臣中却发生了一场轩然大波。御史花杰上书弹劾洪莹罪状，一曰其论“国策”卷文虽好，不属自身修，而是同乡徽州人、翰林院掌院学士戴衢亨在担任阅卷官时，有弄虚作假任意包庇之嫌；二曰洪莹堂兄洪亮吉在位时，因上书批评朝政有欺君之罪，所以被谪伊犁，他们自有不可分割的亲情关系，自然不宜重用。嘉庆帝对此建言非常重视，经过周密调查核实，当即驳回花杰纯属节外生枝的谎言。指出：“朕自处洪亮吉之后，敢于进谏的人越来越少，对于治国安邦极为不利。现在应该肯定。朝臣向君主进言，理所当然，本份之责，言词过激应视逆耳忠言．不足以罪论处。”钦旨，洪亮吉应该无罪释放。至于洪莹与洪亮吉虽属堂房兄弟“事各有主，这何以株连哉!”洪莹论“国策”卷文，经过突查复默，仍然对答如流，“假设与猜疑何能成立伤人哉!”
不久，又有人又在上书弹勤洪莹论“国策”卷文，大谈吏治之道，其实污蔑君父，罪有应得。嘉庆帝阅后，拍案怒道：“朕为治国求言，言者何罪之有？再有无事生非者，当严惩也!’
自此，洪莹对于嘉庆帝的明智决断十分感激，官场险恶，令人伤心。由此不愿继续在朝为官，再三恳求皇帝思准解甲归田。
