因境内有旗内最大的湖泊呼日查干淖尔而得名。
地理位置地处阿巴嘎旗西南部，东与洪格尔高勒镇相接，南与正蓝旗相邻，西与苏尼特左旗毗邻，北与别力古台镇接壤。人民政府驻昌图庙，电话区号0479,邮政编码011419,距旗政府78千米。
政区沿革1949年前，属阿巴嘎右旗南一至四苏木。1949年，成立西部联合旗，后改为三苏木。1955年，查干淖尔苏木辖13嘎查。1958年，查干淖尔苏木改公社。1961年，辖9个生产大队、18个生产小队。1962年，调整为13个生产队。1970年，辖阿拉坦图雅、那仁宝拉格、达布希拉图、查干淖尔、巴彦淖尔、鸟兰图雅、乌兰图嘎、巴彦宝拉格、乌日根温都日勒9个生产队,1个公社牧场、查干淖尔1个渔场。1971年，阿拉坦图雅生产队分为阿拉坦图雅、脑干锡力2个生产队，共辖10个生产队。1981年，达布希拉图生产队分为乌兰宝拉格、达布希拉图2个生产队，共辖11个生产队。1983年，查干淖尔公社改苏木，下辖11个嘎查。2006年，查干淖尔、巴彦德力格尔2苏木合并为查干淖尔镇，下辖16个嘎查、2所在地、1个渔场。
行政区划截至2020年6月，下辖16个嘎查。
统计用区划代码城乡分类代码名称152522102200121乌日根温都日勒嘎查村152522102201220那仁宝拉格嘎查152522102202220脑干锡力嘎查152522102203220乌兰宝拉格嘎查152522102204220阿拉坦图雅嘎查地理环境
植被属半干旱典型草原。东部和北部是低缓的丘陵；中部为冲积平原；西部是大湖；西南和南部为浑善达克沙地。有大小河流8条，著名的高格斯台河流经境内注入呼尔查干淖尔。
属温带半干旱大陆性气候区。
自然资源主要生长植物有小叶锦鸡儿、沙芦、冰草、羊草、糙隐子草、沙鞭、黄柳、芨芨草，有大面积的天然灌木，药用植物有金莲花、香青兰、黄芩、车前、蒲公英、细灯心草、黄花菜等；矿产资源丰富，主要有铜、锌、铁、镍、萤石、芒硝、石英等；矿石矿物有孔雀石、褐铁矿、萤铁矿、黄铜矿、磁铁矿、萤石矿等；野生动物有天鹅、大鸨、鸿雁、灰鹤、鱼鹰、毛腿沙鸡、喜鹊、鱼、猞猁、狐狸、野兔、狼、刺猬等。
社会经济社会经济查干淖尔镇以牧为主，主要牧养牛、绵羊、马、山羊等。1999年末牲畜总头数头（只）。镇所在地有蒙、汉小学各一所，还有卫生院、兽医站、信用社、邮电所、文化站等机构。镇居民区开通了程控电话、安装了有线电视、通网电。交通方便，有通往别力古台镇和南部其它苏木的公路，有柏油路可直达首都北京，有水泥路可直达锡林浩特市。
名胜古迹境内有昌图庙地址，昌图庙建于清雍正年间。是由以嘎拉僧扎拉沁为首的喇嘛他们建的，建庙后在宝日陶勒盖召开第一次庙会。
