黄耀祥致力于水稻育种研究60多年，是我国水稻矮化育种的主要创始人，被国际学术界称为“中国半矮秆水稻之父”。早在20世纪50年代，黄耀祥就引领了我国的第一次绿色革命，他启用矮生性主基因sd-1，育成了我国第一个杂交矮秆籼稻品种“广场矮”（1959年），使我国矮化育种走在世界前列。他对以矮秆为主体的水稻遗传学、生理学、生态学基础与矮秆品种优良性状的关系、创造理想株型与光合作用的关系等进行了较系统的研究，创建了矮化育种、丛化育种、半矮秆早长超高产育种、半矮秆早长超高产特优质育种、半矮秆早长根深超级稻育种等生态育种理论，创造性地提出了加快育种进程的“组群筛选”育种方法，是我国目前开展的超级稻育种的奠基人。
截至1999年，黄耀祥育成广场矮、珍珠矮、广陆矮４号、双桂1号、双桂36、桂朝2号、特青2号、胜优2号、七山占、七秀占、胜泰1号等一大批著名高产优质良种，为提高我国各个历史时期的水稻产量做出了重要贡献。其中，推广面积较大的品种有50多个，其中超过1000万亩的有7个，超过10000万亩的有3个，累计面积达8.4亿亩，增产稻谷845亿公斤，增加产值845亿元。[1]
其他作品他一生笔耕不辍，在科学研究的同时，著有很多权威的论述，如《创造矮秆类型的水稻品种选育工作》、《水稻矮化育种之研究》、《广东省水稻矮化育种工作初步总结》、《水稻杂交育种组群筛选法之研究》、《水稻丛化育种》等。[1]
获得荣誉黄耀祥曾获全国科学大会奖、国家科技发明二等奖、国家科技进步二等奖等多项奖励。荣获全国劳动模范、广东省有突出贡献的专家、全国先进工作者等荣誉称号。第五届全国人大代表。[1]
