2009年4月22日，南沙汽车客运站在南沙区虎门大桥联络道靠近港前大道的位置正式投入使用，广州市交委和南沙区政府联合举行了开业庆典仪式。与此同时，它还在首批开通南沙前往东莞太平、深圳龙华、宝安、龙岗，粤西的罗定、怀集、高州，以及广西南宁、湖南衡阳、江西萍乡、重庆开县、贵州正安以及河南洛阳和南阳等省内外46条长途客运班线，覆盖广东周边5个省（自治区、直辖市），线路最远的达到河南省。南沙客运站有关负责人表示，今后，他们还将根据客流情况的发展，陆续申请开行更多的客运班线。原先位于南沙区江南路上的南沙汽车站，则将在新的南沙客运站投入使用后，从今日起停止运行。25日起，原“天河公交场-南沙天后宫”、“天河公交场-龙穴岛中船基地”两条公交线路合并为1条南沙旅游专线，合并后仍途经天河公交场和龙穴岛中船基地。
途经的公交线路有：
360、361A、361B、362、363、364、365、366、367、
旅游线路 越秀南客运站-百万葵园
