目前，福建神学院共有两个校区：老校区 地址为：福州市仓山区乐群路16号，新校区地址为：福州市仓山区福湾路121号
校园总建筑面积17981.4平方米，主要分为崇拜区、教学区和生活区三部分，崇拜区有礼拜堂、钟楼、副堂、琴房等；教学区有教室、图书馆、学术演讲厅、多功能会议室、办公室等，图书馆藏书目前有8万余册；生活区有食堂、宿舍、健身房、运动场等。
福建神学院
2007年2月福州市政府以划拨价供应一块23.29亩的土地，用于新院建设；2007年5月省发改委已批准新校区建设项目立项；同年8月，福州市城市规划局也颁发了“建设用地规划许可证。2010年5月11日奠基，2011年3月22日开工，于2014年9月建成投入使用。学科设置2015年3月16日，由国家宗教事务局审批同意升格为本科高等基督教神学院校，招收三年制大专班，四年制本科班。教务处依据全国基督教神学教育委员会的办学方针制定教学计划和课程设置，第一年夯实基础，第二年全面提高，第三年拓展视野，第四年理论研究。
神学院图册
其中神学课程占70%，社会学科占30%。神学课程以圣经神学、历史神学、系统神学、实践神学课程为主，社会学科开设文学、哲学、法律、政治、外语、心理学、音乐、钢琴等课程。目前，学院开设的特色课程有《教会管理学》、《福建基督教会史》。办学规模新校区奠基仪式
2015年在读的神学生有150位学生。迄今，学院已为全省基层教会输送教牧人员1137人，成为福建教会教牧队伍的主要力量，也为基督教会高级学府输送人才，在全国各地教会参与服侍。师资队伍学院在1983年办学之初仅有3位专职教师，现有专职教师14人，其中专业课程12人，有博士1人、硕士11人；公共课程2人，皆为硕士学历。公共课程兼职教师共14人，其中博士3人，硕士5人，本科6人。
院领导还注重专职教师的提高，有计划地通过全国基督教两会选派教师出国进行长、短期深造学习，有8人分别从美国、新加坡、中国香港等国家和地区留学归来，取得博士、硕士学位。
学院地址旧校区公交车在附中站下。
新校区公交车在福建神学院下。
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