中药蜜丸的制作方法主要有5个步骤，即粉碎原料、熬炼蜂蜜、混合药蜜、揉搓药丸、分丸干燥等。
1、粉碎原料：将药材粉碎为细末。打好的细末需要用80目左右的过滤筛筛选，防止细末粘连。有一些药材自身含有水分，不易被充分粉碎，可以在初步粉碎的基础上，通过高温加热等方法，使之干燥，之后再继续粉碎。将完全粉碎好的药末，装入干净容器中备用。
2、熬炼蜂蜜：蜂蜜入锅文火加热，待其出现较为密集的小泡后继续加热，等气泡变大，就熬炼妥当了。蜂蜜的熬炼量，应与药粉碎末的重量成正比。一般而言，如果想做较硬的小药丸，可将药末与蜂蜜的比例控制在1：0.7若是想揉搓较软的大药丸，可将二者的比例控制为1：1。
3、混合药蜜：待到蜂蜜熬炼完成，可趁着锅内热度未散，将药粉缓缓倒入其中，慢慢搅动，直至药粉与蜂蜜完全融合。之后将之揉搓成软硬适中的团状物。
4、揉搓药丸：药蜜混合完成后，趁其还未冷却，及时将之揉搓为大小适中的药丸。
5、分丸干燥：将揉好的药丸铺平晾凉，待其干燥后，按剂量分装。
